1-Phenyl-1-nonyne ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และการประยุกต์ใช้ทางวิจัย โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีกลุ่มฟีนิลและอัลไคน์ปลายทางทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น การจับคู่แบบ Sonogashira ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษากิจกรรมของอัลไคน์และในการสังเคราะห์ผลึกเหลวและโพลิเมอร์ โดยคุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีลักษณะทางแสงและอิเล็กทรอนิกส์เฉพาะ