Prop-2-yn-1-yl benzoate ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลาย โครงสร้างของมันซึ่งประกอบด้วยทั้งกลุ่มอัลไคน์และกลุ่มเอสเตอร์ ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาเคมีคลิก โดยเฉพาะในการก่อตัวของไตรอาซอลผ่านการไซโคลอะดีชันของอะซายด์-อัลไคน์ที่เร่งด้วยทองแดง (CuAAC) สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาและโมเลกุลชีวภาพ โดยที่ส่วนอัลไคน์ช่วยให้การปรับแต่งฟังก์ชันมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และวัสดุขั้นสูง ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะที่ปรับแต่งได้ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยในเคมีการแพทย์ ซึ่งช่วยในการออกแบบและปรับปรุงผู้สมัครยา