But-3-yn-1-amine hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น มักใช้ในการพัฒนายาและสารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยกลุ่มฟังก์ชันอัลไคน์และเอมีนช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาต่างๆ เช่น click chemistry และการสร้างพันธะเอไมด์ นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพ รวมถึงยาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาทหรือโรคติดเชื้อ บทบาทในการเตรียมโพลิเมอร์และวัสดุพิเศษสำหรับการใช้งานอุตสาหกรรมก็สำคัญ โดยเฉพาะในสาขาที่ต้องการคุณสมบัติเคมีที่ปรับแต่งได้