ใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาเพื่อติดตามและสังเกตโมเลกุลชีวภาพในเซลล์ โดยเฉพาะในกระบวนการคลิกเคมี (click chemistry) ที่ไม่ต้องใช้ตัวเร่งปฏิกิริยาโลหะ ทำให้เหมาะสำหรับการศึกษาในสิ่งมีชีวิตที่เปราะบาง เช่น เซลล์มีชีวิตหรือสัตว์ทดลอง เนื่องจากมีความเข้ากันได้ทางชีวภาพดี สารนี้สามารถจับกับโมเลกุลที่มีหมู่อาไซด์ (azide) ได้อย่างเฉพาะเจาะจงและรวดเร็ว ทำให้ใช้ในการติดป้ายโปรตีน ดีเอ็นเอ หรือไกลโคโปรตีนที่ต้องการศึกษา ฟลูออเรสเซนต์ไซอันีน 5.5 (Cy5.5) ที่ต่ออยู่ให้การเรืองแสงในช่วงอินฟราเรดใกล้ (near-infrared) ซึ่งช่วยลดการรบกวนจากแสงเรืองของเซลล์หรือเนื้อเยื่อ ทำให้ภาพที่ได้มีความชัดเจนสูง เหมาะสำหรับการถ่ายภาพทางชีวภาพ เช่น การถ่ายภาพเนื้องอกหรือการติดตามเซลล์ในร่างกาย