สาร endo-BCN-PEG3-acid ถูกใช้เป็นตัวทำหน้าที่เชื่อมต่อในปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) โดยเฉพาะปฏิกิริยากับโมเลกุลที่มีกลุ่ม azide ผ่านปฏิกิริยา SPAAC (Strain-Promoted Alkyne-Azide Cycloaddition) ซึ่งไม่ต้องใช้ตัวเร่งปฏิกิริยาโลหะ ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในระบบชีวภาพ เนื่องจากมีหมู่กรดคาร์บอกซิลิก สารนี้สามารถทำปฏิกิริยากับหมู่อะมีนบนโปรตีนหรือเพปไทด์ได้โดยใช้ตัวทำให้เกิดพันธะข้าม เช่น EDC/NHS ทำให้สามารถนำสารนี้ไปต่อพ่วงกับโมเลกุลชีวภาพได้อย่างมีประสิทธิภาพ โครงสร้าง PEG3 ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายน้ำ และลดการจับตัวกันไม่เฉพาะเจาะจง ทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในงานด้านชีวโมเลกุล เช่น การติดฉลากฟลูออเรสเซนต์ การสร้างคอนจูเกตของแอนติบอดี หรือการส่งยาเฉพาะเป้าหมาย โดยรวม สารนี้จึงนิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุล ชีวเคมี และการพัฒนายาที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง