เอสเตอร์โพรพาร์จิลเมทาเนซัลโฟเนตถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารอัลคิเลติ้งเอเจนต์ที่อเนกประสงค์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าในการเตรียมอนุพันธ์โพรพาร์จิล ซึ่งเป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายาเภสัชกรรม สารเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในปฏิกิริยาเคมีคลิก โดยช่วยอำนวยความสะดวกในการก่อตัวของไตรอะซอลผ่านการไซโคลอะดีชันอะซายด์-อัลไคน์ที่เร่งปฏิกิริยาด้วยทองแดง นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารเคมีหลักในการปรับเปลี่ยนไบโอโมเลกุล ทำให้สามารถนำกลุ่มโพรพาร์จิลเข้าไปเพื่อการฟังก์ชันนาไลเซชันหรือการติดฉลากเพิ่มเติมในการศึกษาทางชีวเคมี การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ โดยใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติเฉพาะที่ปรับแต่งได้