สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในสาขาการเชื่อมโยงทางชีวภาพ (bioconjugation) และเคมีคลิก (click chemistry) กลุ่ม trifluoroethyl ช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยา ทำให้มีคุณค่าต่อการติดตั้งโซ่ polyethylene glycol (PEG) กับโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน เพปไทด์ หรือแอนติบอดี กระบวนการนี้ช่วยปรับปรุงความละลาย ความเสถียร และ bioavailability ของโมเลกุลชีวภาพเหล่านี้ ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายาและการประยุกต์ใช้ทางรักษา

นอกจากนี้ กลุ่ม propargyl ช่วยให้เกิดปฏิกิริยา copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) ได้อย่างมีประสิทธิภาพ สามารถเชื่อมโยงโมเลกุลได้อย่างแม่นยำและรวดเร็วในงานวิจัยและการผลิตอุตสาหกรรม การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนาระบบการส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย เครื่องมือวินิจฉัย และวัสดุขั้นสูงในนาโนเทคโนโลยี