ใช้ในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการผลิตอนุพันธ์ของไนโตรเจนมัสตาร์ดสำหรับการรักษามะเร็ง ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในสารอัลคิลเลติ้งเอเจนต์ เนื่องจากมีกลุ่มคลอโรเอทิล ซึ่งสามารถก่อตัวเป็นไอออนอะซีริดิเนียมที่ทำปฏิกิริยาได้และจับกับดีเอ็นเอ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารโคลิเนอร์จิกและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่ต้องการโครงสร้างเอทานอลเอมีนที่ถูกปรับแต่ง รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและความละลายในระบบปฏิกิริยาน้ำ