ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในงานสังเคราะห์สารชีวภาพที่ซับซ้อน เช่น การสร้างสารประกอบแอลคาลอยด์ หรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น ๆ หมู่ tert-butyldimethylsilyl (TBS) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่แอลกอฮอล์ไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ ซึ่งช่วยเพิ่มความเลือกจำเพาะในการทำปฏิกิริยา โครงสร้างของสารนี้มีหมู่คีโตนและหมู่อีเทอร์ที่ถูกป้องกัน ทำให้สามารถนำไปใช้ต่อในปฏิกิริยาต่าง ๆ เช่น การเติมสารนิวคลีโอไฟล์ การรีดิวซ์ หรือการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนได้อย่างมีประสิทธิภาพ หลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ป้องกัน TBS ออกได้ง่ายด้วยตัวทำละลายที่มีฟลูออไรด์ เช่น TBAF เพื่อเปิดหมู่แอลกอฮอล์อีกครั้งสำหรับขั้นตอนต่อไป