5,5,5-Trifluoropent-2-enoic acid ถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบต่างๆ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของสารที่ได้ นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรียหรือไวรัส รวมถึงการประยุกต์ใช้ในด้านวัสดุศาสตร์เพื่อปรับปรุงคุณสมบัติของโพลิเมอร์หรือสารเคลือบพิเศษ