ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการโครงสร้างอะโรมาติกฟลูออรีนเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ ฟังก์ชันเอสเตอร์ช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นิยมใช้ในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากมีกลุ่มไตรฟลูออโรมอกซี่ซึ่งมีผลต่อลิโพฟิลิกและคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบสารป้องกันพืชใหม่ที่สารฟลูออรีนมักแสดงประสิทธิภาพที่ดีขึ้นและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม