ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกลุ่มยาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) ซึ่งมีฤทธิ์ลดอาการปวด ลดไข้ และลดการอักเสบ โครงสร้างที่มีหมู่ไตรฟลูโอมีทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมัน และช่วยให้สารออกฤทธิ์ได้ดีขึ้นในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารต้านจุลชีพหรือสารปรับภูมิคุ้มกัน