ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่มีผลต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและวิตกกังวล โครงสร้างไซโคลโพรเพนที่มีหมู่ฟลูออรีนและไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มสมองและเพิ่มความจำเพาะต่อตัวรับในสมอง ทำให้มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและลดผลข้างเคียง นิยมใช้ในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนายาใหม่ที่ต้องการควบคุมโครงสร้างโมเลกุลให้มีเสถียรภาพและออกฤทธิ์เฉพาะจุด