ใช้เป็นตัวกลางสำคัญ (key intermediate) ในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรมที่มีฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายากดการอักเสบและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (central nervous system agents) โครงสร้างฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการเข้าถึงทางชีวภาพ (bioavailability) ในตัวยาที่เป็นผู้สมัครยา (drug candidates) มักใช้ในเคมียารักษา (medicinal chemistry) สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR studies) เนื่องจากอิทธิพลของอะตอมฟลูออรีนต่อความเข้มข้นการจับ (binding affinity) และความชอบไขมัน (lipophilicity) นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ (analogs) สำหรับการคัดกรองทางชีวภาพ (biological screening) ในขั้นตอนเริ่มต้นของการค้นพบยา (early-stage drug discovery)