ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรมเป็นส่วนประกอบหลักสำหรับโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายารักษาโรคเมแทบอลิซึมและยาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) โครงสร้างไซโคลบิวทิลที่มีการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากความแข็งตัวเชิงโครงสร้างและลักษณะฟลูออรีน นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งเอนไซม์ซึ่งการฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความสัมพันธ์การจับและความต้านทานต่อการย่อยสลายแบบออกซิเดชัน