N-Boc-N-methyl-3-chloro-1-propanamine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นสำคัญสำหรับการเตรียมยาและสารประกอบชีวภาพต่างๆ กลุ่มปกป้อง Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยช่วยในการปกป้องกลุ่มอะมีนอย่างเลือกเฉพาะในปฏิกิริยาหลายขั้นตอน สารนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายับยั้งโมเลกุลขนาดเล็กและยารักษาอื่นๆ มักทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโครงสร้างที่ซับซ้อนมากขึ้น นอกจากนี้ กลุ่มคลอโรช่วยให้สามารถดัดแปลงเพิ่มเติมได้ ส่งเสริมการสร้างสารเคมีหลากหลายสำหรับการค้นพบยาและการวิจัยทางเคมียารักษา