3-Pentyn-2-ol ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันที่มีทั้งอัลไคน์และกลุ่มไฮดรอกซิล ทำให้มีความยืดหยุ่นในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ มักใช้ในการเตรียมเภสัชภัณฑ์ ซึ่งสามารถทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ส่วนผสมเภสัชกรรมที่ออกฤทธิ์ (APIs) นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีพิเศษ รวมถึงสารเคมีเกษตรและโพลิเมอร์ ซึ่งกลุ่มปฏิกิริยาของมันสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อให้ได้คุณสมบัติที่ต้องการ ในงานวิจัย 3-Pentyn-2-ol ใช้ในการศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ โดยเฉพาะในสาขาเคมีคลิก ความสามารถในการเข้าร่วมปฏิกิริยาที่มีพื้นฐานจากอัลไคน์ เช่น ไซโคลอะดีชัน ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนอย่างมีประสิทธิภาพ