3-Undecyne ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนกว่า มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารเคมีพิเศษ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร กลุ่มฟังก์ชันอัลไคน์ของมันทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาเคมีคลิก ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีความจำเพาะสูงและมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสังเคราะห์โพลิเมอร์และวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติที่ปรับแต่งได้ ในงานวิจัย 3-Undecyne มักถูกใช้ในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนและกระบวนการเร่งปฏิกิริยา