1,5,9-Decatriene ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโครงสร้างทางเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น ระบบไตรอีนแบบคอนจูเกตของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการผลิตโพลิเมอร์และเรซิน ซึ่งสามารถเพิ่มคุณสมบัติเช่น ความยืดหยุ่นและความทนทาน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษ รวมถึงน้ำหอมและสารปรุงแต่งรส เนื่องจากสามารถมอบลักษณะหอมเฉพาะตัว ในงานวิจัย มันทำหน้าที่เป็นสารตัวอย่างสำหรับศึกษากลไกปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับระบบคอนจูเกต โดยเฉพาะในการพัฒนากระบวนการเร่งปฏิกิริยาใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งช่วยในการสร้างวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และแสงที่ปรับแต่งได้