ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นเอสเตอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ในกระบวนการแปลงสารอินทรีย์ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถนำหมู่ฟีโนกซี (phenoxy-based) เข้าสู่โมเลกุลที่ใหญ่กว่าได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช หมู่คลอโรฟีโนกซีช่วยเพิ่มลิโพฟิลิก (lipophilicity) ซึ่งช่วยในการทะลุเยื่อหุ้มเซลล์ในสารชีวภาพที่ออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในสูตรการปลดปล่อยแบบควบคุมเนื่องจากสามารถเกิดการตัดด้วยเอนไซม์หรือการไฮโดรไลซิส ทำให้สามารถส่งมอบสารออกฤทธิ์ในเวลาที่กำหนด การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงเคมีโพลิเมอร์ในฐานะสารเชื่อมข้ามหรือสารดัดแปลงในเรซินพิเศษ