2,4-Dimethoxybenzylamine hydrochloride ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียดต่าง ๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง นอกจากนั้น ยังพบการใช้งานในงานวิจัยเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ ๆ ความหลากหลายและความตอบสนองต่อปฏิกิริยาทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในการเตรียมเคมีภัณฑ์พิเศษสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมและวิทยาศาสตร์