2,3,6-ไตรคลอโรไอโอโดเบนซีนถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น เนื่องจากมีกลุ่มฮาโลเจนที่ทำปฏิกิริยาได้ ในด้านสารเคมีเกษตร มันช่วยในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ในเภสัชกรรม มันช่วยในการสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้สำหรับยาต่างๆ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในการผลิตเคมีภัณฑ์ละเอียด นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อศึกษาคุณสมบัติของสารประกอบอะโรมาติกที่ถูกฮาโลเจนแทนที่