(S)-2-Ethylpiperazine ถูกนำมาใช้เป็นหลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างแบบ chiral ของมันทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตสารประกอบที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายาที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและมีผลข้างเคียงน้อยลง นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร เพื่อช่วยพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่มีความเลือกสรรสูงขึ้นและปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อมมากขึ้น บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปสู่การผลิตสารเคมีพิเศษที่ใช้ในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม