(2-Chloro-3-methylphenyl)methanamine ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่าง ๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท รวมถึงยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต โครงสร้างของสารประกอบนี้ช่วยให้สามารถโต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมองได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่ควบคุมอารมณ์และหน้าที่ทางความรู้ความเข้าใจ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในสถานที่วิจัยเพื่อศึกษากลไกทางชีเคมีที่เกี่ยวข้องกับภาวะสุขภาพจิต ช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่ ๆ การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปถึงการพัฒนาสารเคมีเกษตร ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่มีประสิทธิภาพและความเลือกสรรที่ดีขึ้น