Pentachlorothioanisole ใช้เป็นสารเคมีในการศึกษาวิจัยด้านสิ่งแวดล้อมและพิษวิทยา เนื่องจากเป็นสารที่เกิดขึ้นจากการย่อยสลายของสารเคมีกำจัดศัตรูพืช เช่น pentachlorophenol ในสิ่งแวดล้อม มักถูกนำมาใช้ในการศึกษากระบวนการ biodegradation และการเคลื่อนย้ายของสารเคมีในระบบนิเวศ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิเคราะห์ผลกระทบต่อสิ่งมีชีวิตในน้ำและดิน เพื่อประเมินความเสี่ยงทางสิ่งแวดล้อมที่อาจเกิดขึ้นจากสารเคมีชนิดนี้