เบนโคลนิดีนใช้หลักในการรักษาโรคต้อหินและความดันในตาสูงในสาขาจักษุวิทยา โดยทำงานผ่านการลดการผลิตของน้ำหล่อเลี้ยงและเพิ่มการไหลออกของน้ำหล่อเลี้ยง ทำให้ลดความดันภายในลูกตา ซึ่งช่วยป้องกันความเสียหายต่อประสาทตาและรักษาการมองเห็น นอกจากนี้ เบนโคลนิดีนยังใช้ในขั้นตอนการวินิจฉัยเพื่อประเมินอาการของกลุ่มอาการฮอร์เนอร์ เนื่องจากช่วยแยกแยะระหว่างรอยโรคก่อนและหลังแก๊งเกลียน คุณสมบัติหดหลอดเลือดของมันยังมีประโยชน์ในการจัดการอาการตาแดงและระคายเคือง โดยให้การบรรเทาอาการในภาวะเช่น ตาแพ้ภูมิแพ้ การใช้เบนโคลนิดีนควรอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์ เพื่อให้ได้ผลการรักษาที่เหมาะสมและหลีกเลี่ยงผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้น