Atto 425-NHS ester ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการติดฉลากฟลูออเรสเซนซ์ของไบโอโมเลกุล เช่น โปรตีน เพปไทด์ และแอนติบอดี กลุ่ม NHS ester ของมันทำปฏิกิริยากับอะมีนปฐมภูมิอย่างมีประสิทธิภาพภายใต้สภาวะอ่อนโยน สร้างพันธะอะไมด์ที่มั่นคง ทำให้เหมาะสำหรับการคอนจูเกตโดยไม่รบกวนกิจกรรมทางชีวภาพของโมเลกุลเป้าหมาย เนื่องจากมีผลผลิตควอนตัมฟลูออเรสเซนซ์สูงและความคงทนต่อแสงที่ดี จึงมีประโยชน์อย่างยิ่งในการไมโครสโคปฟลูออเรสเซนซ์ รวมถึงการถ่ายภาพ confocal และ super-resolution นอกจากนี้ ยังถูกใช้ใน flow cytometry และ immunoassays ที่ใช้ฟลูออเรสเซนซ์ซึ่งต้องการสัญญาณที่สว่างและสม่ำเสมอ โปรไฟล์การกระตุ้นและการปล่อยของสีย้อมในบริเวณน้ำเงิน-เขียวช่วยให้รวมเข้ากับเลเซอร์และชุดฟิลเตอร์ทั่วไปได้ง่าย และสามารถใช้ในงานทดลอง multiplex ร่วมกับฟลูโอโรไฟร์อื่น ๆ เพิ่มเติม สามารถใช้ติดฉลากกรดนิวคลีอิกเมื่อคอนจูเกตกับโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ปรับแต่งด้วยอะมีน การจับกับโมเลกุลชีวภาพเกิดขึ้นผ่านปฏิกิริยานิวคลีโอไฟล์ของหมู่อะมิโนกับหมู่ NHS ester ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ส่งผลให้เกิดพันธะที่มั่นคงและฟลูออเรสเซนต์ที่ติดแน่นกับตัวอย่าง ทำให้สามารถติดตาม การกระจายตัว หรือการมีอยู่ของเป้าหมายในระบบชีวภาพได้อย่างแม่นยำ