สารประกอบบอโรนไตรฟลูออไรด์อะซิติกแอซิดเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในปฏิกิริยาสังเคราะห์อินทรีย์หลากหลายประเภท โดยมีประสิทธิภาพสูงในการส่งเสริมกระบวนการเอสเทอร์รีฟิเคชัน โพลิเมอไรเซชัน และอัลคิเลชัน ในกระบวนการผลิตเรซินและพลาสติก มันทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหลักเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการโพลิเมอไรเซชัน นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีละเอียด ซึ่งช่วยในการก่อตัวของโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ความสามารถในการทำหน้าที่เป็นกรดลิวอิสทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาที่ต้องการสภาวะกรด เช่น ปฏิกิริยา Friedel-Crafts สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารประกอบที่มีบอโรน ซึ่งจำเป็นต่อวิทยาศาสตร์วัสดุและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม