3-Methoxypropanoyl chloride ใช้หลักๆ เป็นสารเคมีตัวทำปฏิกิริยาในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยมีคุณค่าต่อการนำกลุ่ม 3-methoxypropanoyl เข้าสู่โมเลกุลต่างๆ มักใช้ในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยช่วยในการก่อตัวของเอสเทอร์ เอไมด์ และอนุพันธ์อื่นๆ ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับแอลกอฮอล์และเอมีนทำให้มีประโยชน์ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) และสารกลาง นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษ รวมถึงสารเคมีเกษตรและเคมีภัณฑ์ละเอียด ซึ่งต้องการการแปลงกลุ่มฟังก์ชันอย่างแม่นยำ บทบาทในกระบวนการอะซิเลชันมีส่วนสำคัญในการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน