6-Chloropicolinoyl chloride ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ มีบทบาทสำคัญในการผลิตสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลซับซ้อนในการวิจัยเภสัชกรรม ช่วยในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษ รวมถึงสีย้อมและเม็ดสี ซึ่งกลุ่ม chloropicolinoyl มีส่วนช่วยในคุณสมบัติเคมีที่ต้องการ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ใช้ในการปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์เพื่อเพิ่มคุณสมบัติเฉพาะ เช่น ความเสถียรหรือความสามารถในการทำปฏิกิริยา