3-Bromo-2-fluorobenzene-1-sulfonyl chloride ใช้หลัก ๆ เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มซัลโฟนิลคลอไรด์ที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยในการสร้างซัลโฟนาไมด์ ซัลโฟเนตเอสเตอร์ และอนุพันธ์อื่น ๆ ผู้แทนบรอมและฟลูออโรช่วยเพิ่มประโยชน์ในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ซึ่งช่วยในการนำวงแหวนอะโรมาติกเข้าไปในสารเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงผู้สมัครยา โดยที่กลุ่มซัลโฟนิลมีบทบาทสำคัญในการปรับกิจกรรมและ bioavailability