กรดฟอสโฟทังสติกถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในฐานะตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาการสังเคราะห์สารอินทรีย์ต่างๆ รวมถึงการเอสเทอร์การไฮโดรไลซิส และกระบวนการออกซิเดชัน เนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นกรดที่แข็งแรงและคุณสมบัติการออกซิเดชันที่ทรงพลัง มันถูกใช้ในการเตรียมสารเคมีละเอียดและยาเสพติด โดยช่วยอำนวยความสะดวกในการแปลงที่ประสิทธิภาพและเลือกสรร ในเคมีวิเคราะห์ มันทำหน้าที่เป็นรีเอเจนต์สำหรับการตกตะกอนของโปรตีน อัลคาลอยด์ และกรดอะมิโน เพื่อช่วยในการแยกและทำให้บริสุทธิ์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตเม็ดสีและสีย้อม โดยทำหน้าที่เป็นมอร์แดนต์เพื่อปรับปรุงความคงทนของสี ในวิทยาศาสตร์วัสดุ กรดฟอสโฟทังสติกถูกใช้ในการปรับเปลี่ยนพื้นผิวและสร้างชั้นเคลือบฟังก์ชันที่มีคุณสมบัติเพิ่มเติม เช่น ความต้านทานการกัดกร่อนและกิจกรรมการเร่งปฏิกิริยา มันยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาเมมเบรนนำโปรตอนสำหรับเซลล์เชื้อเพลิง ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาเทคโนโลยีพลังงานสะอาด