3'-Chloro-5'-fluoroacetophenone ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของมันมีทั้งกลุ่มคลอรีนและฟลูออรีน ซึ่งช่วยเพิ่มความหลากหลายในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างทางเคมี นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ เพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา และการออกแบบโมเลกุลที่มีประสิทธิภาพสูง เนื่องจากสามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย และช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีความซับซ้อนมากขึ้น ในอุตสาหกรรมเกษตร เคมีชนิดนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารกำจัดศัตรูพืชหรือสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากมีความเสถียรและสามารถปรับเปลี่ยนให้เหมาะสมกับการใช้งานได้ง่าย