ตัวกลางส่งสัญญาณภายในเซลล์คือโมเลกุลที่ถ่ายทอดสัญญาณจากสิ่งกระตุ้นภายนอกสู่เป้าหมายภายในเซลล์ เพื่อกระตุ้นการตอบสนองของเซลล์ รวมถึงนิวคลีโอไทด์แบบวงกลม ไอออน และลิพิดที่จำเป็นสำหรับกระบวนการเช่น การส่งสัญญาณและการควบคุมหน้าที่ทางสรีรวิทยา