เอสเตอร์เบต้า-คีโตเป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่สำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ ช่วยในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาเช่น คลาเซน คอนเดนเซชัน อัลคิเลชัน และไซคลิเซชัน พวกมันถูกใช้อย่างแพร่หลายในการพัฒนายาเนื่องจากความตอบสนองและความสามารถในการนำเข้าฟังก์ชันคาร์บอนิล