(S)-Boc-3-methoxy-β-Phe-OH เป็นสารเคมีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะบล็อกก่อสร้างสำหรับสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการเตรียมเปปไทด์ที่มี stereochemistry เฉพาะ เนื่องจากมี chiral center กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็น protecting group สำหรับฟังก์ชันอะมีน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ไซต์อื่นๆ ระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ กลุ่มเมทอกซีบนเบนซีนริงสามารถมีอิทธิพลต่อการโต้ตอบของเปปไทด์กับเป้าหมายทางชีวภาพ ทำให้มีประโยชน์ในการค้นพบและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์กรดอะมิโนที่ดัดแปลง ซึ่งมีความสำคัญในการศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่เคมีทางการแพทย์ ที่ซึ่งถูกใช้ในการออกแบบและปรับปรุงเปปไทด์ชีวกิจและเปปไทโดมิมเมติกส์