ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม เนื่องจากหมู่ Fmoc ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน โครงสร้างที่มีไซคลิกไทอะโซลและหมู่ธีนิลช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนเป้าหมาย ทำให้เหมาะสำหรับการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง เช่น สารยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์สำหรับตัวรับเฉพาะ มักใช้ในงานออกแบบเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรม (SAR)