ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่อัลดีไฮด์ช่วยให้สามารถทำการปรับโครงสร้างได้ง่าย ส่งผลให้เกิดอิมีน ออกไซม์ และอนุพันธ์อื่นๆ ที่สำคัญในเคมียารักษาโรค ใช้บ่อยในการเตรียมลิแกนด์และตัวเร่งปฏิกิริยาที่มีฐานเป็นพิริดีน เนื่องจากผลดึงอิเล็กตรอนของหมู่ไตรฟลูโอโรมิทิล ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและมีอิทธิพลต่อปฏิกิริยา นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างโปรบเรืองแสงและเซ็นเซอร์ โดยโครงสร้างพิริดีนไตรฟลูโอเมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมันและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในระบบชีวภาพ