ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีนที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพที่ดีขึ้น หมู่ตรีฟลูออร์เมทอกซีที่มีคุณสมบัติดูดอิเล็กตรอนทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกและในเคมียารักษาโรคสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างอะโรมาติก ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาต้านเชื้อรา ยาต้านการอักเสบ และตัวยับยั้งเอนไซม์แบบเลือกเพศ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมน้ำหอมเนื่องจากคุณสมบัติอัลดีไฮด์อะโรมาติก ช่วยในการออกแบบโมเลกุลกลิ่นใหม่ที่มีความเสถียรดีขึ้น