กรดเฮปตาฟลูออโรบิวไทริกถูกใช้อย่างแพร่หลายในเคมีวิเคราะห์เป็นสารจับคู่อิออนในโครมาโตกราฟีของเหลว โดยเฉพาะสำหรับการแยกและวิเคราะห์เปปไทด์ โปรตีน และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ คุณสมบัติการจับคู่อิออนที่แข็งแกร่งช่วยเพิ่มการกักเก็บและความละเอียดของสารประกอบที่มีขั้วบนคอลัมน์เฟสกลับ ในโปรเตโอมิกส์ มันมักถูกใช้เพื่อปรับปรุงการตรวจจับและการวิเคราะห์ปริมาณเปปไทด์ที่มีปริมาณต่ำระหว่างสเปกโตรเมตรีมวล นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสาร derivatization ในโครมาโตกราฟีก๊าซเพื่อเพิ่มความผันผวนและการตรวจจับของสารวิเคราะห์บางชนิด การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือสารเคมีในปฏิกิริยาฟลูออรีนและเอสเทอร์ification ต่างๆ